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Biomoléculas – composição
química, estructura e reactividade
AULA BIOQUÍMICA
2.1 PROTEÍNAS:
ENZ IM A S
PROPRIEDADES, CINÉTICA ENZIMÁTICA E
REGULAÇÃO DA ACTIVIDADE ENZIMÁTICA
E+S ES EP E+P
Decréscimo da
energia do estado
de transição
EC 1 . 2 . 3 . 4
1. Corresponde à classe de enzima (existem 6)
2. Correponde à Sub-classe (no caso da classe 1, define o dador de electrões)
3. Corresponde à Sub-sub-classe (na classe 1, define o aceitador de electrões)
4. Esta posição corresponde ao número de série na Subsub-classe
+ H- (ião hidreto)
Incluem-se as
• Desidrogenases
• Redutases
• Oxidases
• Oxigenases
EC 2.6.2.1
L-glutamato
piruvato 2-oxoglutarato L-alanina
Outro exemplo são as cinases, que transferem grupos fosfato do ATP para
uma biomolécula
EC 3.4.21.4
EC 4.1.1.1
+ ADP
SinteTAse e
Sintase não é o
mesmo
ATIV ID A D E ENZ IM Á T IC A
Velocidade inicial
Presença de Activadores
Enzima Taq
humano DNA polimerase
Actividade
37 ºC 72 ºC
Temperatura Da bactéria termófila
Thermus aquaticus
Cofactor é uma entidade química não proteica que é necessária para o enzima
catalizar a reacção. Os cofactores ou os coenzimas podem ser metálicos, podem
estar ligados covalentemente (ou muito fortemente) ligados à proteína (por vezes
designam-se grupos prostéticos) ou participarem nas reacções como “co-
substratos”.
e-
Acetil Coenzima A
[Fe-S] clusters
Centros de ferro-enxofre
Aconitase (TCA)
Zinc Finger
3 Zn-finger a
Hemo (metal é Fe) promover a
ligação ao DNA
Acção da Quimotripsina
2º -Catálise covalente
1º -Catálise ácido-base
CINÉTICA ENZIMÁTICA
Mecanismo
BiBi ao acaso
A P Conceito básico:
A velocidade inicial (v0) deve ser proporcional à concentração de Enzima
v0 = k[E0]
E EA E A velocidade é também dependente da [substrato]
k1 k2 Assim, [E0] = [E] +[EA] e tb [A0] = [A] +[EA]
A+E EA E+P Como [E] <<[A] , a cada instante [A0] [A]
k -1
Se houver um equilibrio na ligação do substrato (k2 << k -1) então
[ E ].[ A] ([ E0 ] [ EA])[ A]
K
[ EA] [ EA]
[ E ].[ A]
V .[ A] donde [ EA] 0
v0 K [ A]
A P
=V
E EA E
k1 k2
A+E EA E+P
k -1
V .[ A]
v0
K m [ A]
A P =V
V .[ A]
v0
K m [ A]
E EA E
k1 k2
A+E EA E+P
k -1
A P =V
V .[ A]
v0
K m [ A]
E EA E
k1 k2
A+E EA E+P
k -1
Caso prático:
têm dois enzimas NOD1 e NOD2, que usam o mesmo substrato.
O NOD1 tem Km = 30 μM e V = 10 mol.s-1
O NOD2 tem Km = 2 mM, e V = 300 mol.s-1.
Quando a concentração de substrato é de 200 μM, qual dos enzimas vai ser o
mais eficiente a catalizar este substrato?
A B P
=V
E EA EAB E V .[ A]
v0
k1 k2 K m [ A]
A+E EA E+P
k -1
São feitos vários ensaios com [E] constante, em que se varia a [substrato] e se
medem a velocidade inicial de cada ensaio /reacção.
São feitos vários ensaios com [E] constante, em que se varia a [substrato] e se
medem a velocidade inicial de cada ensaio /reacção.
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V .[ A]
v0
K m [ A]
São feitos vários ensaios com [E] constante, em que se varia a [substrato] e se
medem a velocidade inicial de cada ensaio /reacção.
São feitos vários ensaios com [E] constante, em que se varia a [substrato] e se
medem a velocidade inicial de cada ensaio /reacção.
São feitos vários ensaios com [E] constante, em que se varia a [substrato] e se
medem a velocidade inicial de cada ensaio /reacção.
[A] v0 V
-[A]
1 1 v2
E v3
2 5 v0
3 10
4 12 -a1 -a2 -a3 Km
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Prof. Marta Justino ESTBarreiro - IPS 2017/2018
Enzimas
INIBIÇ Ã O D A ATIV ID A D E
ENZ IM Á T IC A
A velocidade limite
mantém-se constante,
mas o Km diminui
Nesta inibição o
parâmetro constante é
Km/V
1/(1-Ki/Kii)V
[I] [I] [I]
-Ki -Ki
Km(1-Ki/Kii)V -Kii
[I]
1. Fosforilação-desfosforilação
1. Fosforilação-desfosforilação
Cascatas de sinalização intracelular
1. Fosforilação-desfosforilação
Existem outros tipos de modificações covalentes, mas são menos
relevantes para regulação enzimática
1. Proteólise de zimogéneos
Zimogéneos são pro-enzimas que estão inactivas.
Quando são hidrolisadas por uma protease ou peptidase (reacção de proteólise)
ficam activos. Exemplo é o tripsinogénio do suco gástrico.
Activação do Activação da
quimotripsinogénio procarboxilase Regulação genética +
Activação da dos níveis de -
proelastase
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Prof. Marta Justino ESTBarreiro - IPS 2017/2018
bibliografia
Capitulo 18, 19 e 20