ESTRUTURA

TRIDIMENSIONAL
DE PROTEÍNAS:
ESTRTUTURAS
TERCIÁRIAS E
QUATERNÁRIAS
1

Os quatro níveis de estrutura de proteínas

Estrutura Estrutura Estrutura Estrutura

primária secundária terciária Quaternária
N

C
Às vezes, há várias
Sequência de Conformações Como a cadeia cadeias polipeptídicas
aminoácidos comuns dentro polipeptídica, que formam
da proteína como um tudo, complexos estáveis
+ se enovela em três (por exemplo, na
(α-hélices e
Localização dimensões hemoglobina)
β-conformações)
de ligações
dissulfeto (entre
resíduos de cys)
2
olhando a estrutura tridimensional em vários níveis diferentes

1
Objetivo desta seção
Entender que proteínas têm estruturas
tridimensionais apropriadas para suas funções
(dependendo da proteína, isto pode incluir relações
entre cadeias polipeptídicas diferentes)
Quais funções uma proteína pode ter? Entre outros:
• fornecer resistência mecânica
• catalisar reações (enzimas)
• atuar como hormônios
• transportar/armazenar moléculas

Proteína fibrosa: α-queratina

α-queratinas
• encontradas em mamíferos – em cabelos, lá, unhas,
garras, espinhos, chifres, cascos, camada externa da
pele
• têm a função de dar resistência
• como nós já vimos, o polipeptídeo “básico” das
α-queratinas forma uma α-hélice
• ou seja, a estrutura terciária é
100% α-hélice
• mas a α-queratina também tem
uma estrutura quaternária

2
 Proteína fibrosa: α-queratina
α-hélice de uma
cadeia polipeptídica
Superenovelamento
de duas cadeias
Isto é uma estrutura
quaternária!
Duas fitas de α-queratina, orientadas em
É um “dímero” (há duas
paralela (quer dizer, os aminoterminais
cadeias polipeptídicas)
das duas fitas são na mesa extremidade)
São enovelados para produzir uma espiral
super-retorcida (a espiral é orientada
para a esquerda)

Proteína fibrosa: α-queratina

uma α-hélice

dímero

tetrâmero
= dois dímeros se
alinhados (antiparalelos)
Chama se protofilamento”
o filamento
também tem intermediário
organização dos tem 32 cadeias
tetrâmeros em de α-queratina
escalas maiores... (consiste de 8
tetrâmeros)

filamento intermediário
6

3
 Proteína fibrosa: α-queratina

Ligações dissulfeto entre o filamento

hélices
tambémalinhadas
tem intermediário
organização dos tem 32 cadeias
Cisteína pode representar 25% de α-queratina
tetrâmeros em
do total dos aminoácidos em α- (consiste de 8
escalas maiores...
queratina (para queratinas mais tetrâmeros)
duras). No cabelo, representa
aproximadamente 14% dos
aminoácidos
filamento intermediário
7

Engenharia de cabelo: onda permanente

cabelo no rolo

oxidante
enrola o
redutor
agente

agente

4
 Proteína fibrosa: colágeno

• colágeno é uma proteína encontrada em tecidos

conjuntivas... tendões, cartilagens, na matriz orgânica
dos ossos e na córnea dos olhos
• tem a função de fornecer resistência mecânica
• tem uma composição (em termos dos aminoácidos) e
estrutura única

Proteína fibrosa: colágeno

COO-
composição do colágeno
H3N
+
C H COO-
• 35% glicina +
H H3N C H
• 11% alanina
CH3
• 21% prolina e hidroxiprolina

COO- COO-
C H hidroxilação C H
+ +
H2N CH2 H2N CH2
(a modificação
ocorre depois da
H2C CH2 H2C CH OH
incorporação de
prolina prolina na proteína) hidroxiprolina
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5
 Proteína fibrosa: colágeno
uma hélice de mão esquerda
(não é uma α-hélice)
modelo modelo
“bastão-e-bola” “espaço-cheio”
a hélice tripla de colágeno (tem
três hélices de mão esquerda,
retorcidas para formar uma
hélice tripla de mão direita)

vista de lado vista de cima

(modelo (modelo de
“espaço-cheio”) “bastão-e-bola”)

resíduos de
glicina em
vermelha

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Proteína fibrosa: colágeno

...debaixo do microscópio eletrônico

a fibrila de
colágeno é uma
estrutura
supramolecular

cada linha azul

representa uma
hélice tripla

em amarelo,
tem as ligações tripla cada hélice
cruzadas hélice tem ~100012a.a.

6
 Proteína fibrosa: colágeno
• no colágeno, a ligação cruzada entre as moléculas não é por
ligação dissulfeto
• tem vários tipos de ligações cruzadas diferentes
• um tipo de ligação cruzada envolve dois resíduos de lisina
(modificados - a modificação ocorre depois da incorporação de lisina
na proteína)

um resíduo de

polipeptídica
outra cadeia
polipeptídica

lisina, mas sem um resíduo de

uma cadeia

o grupamento de lisina, com uma

amino no substituição (-OH)
terminal do no grupo R
grupo R
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Proteína globular: mioglobina

• presente nos músculos de vertebrados em geral

(especialmente em mamíferos)
• tem função de armazenar O2 nos músculos
(é particularmente abundante nos músculos de baleias)
• uma única cadeia polipeptídica de 153 resíduos de
aminoácidos
• contém um grupo prostético (ou seja, contém uma
molécula que não seja feita por aminoácidos) = heme

14

7
 Proteína globular: mioglobina
Duas representações diferentes
(com a proteína na mesma orientação)
uma representação do
modelo em fita: contorno da superfície
tem várias α-hélices o grupo heme é, na maior parte,
“enterrada” na proteína, portanto,
somente uma parte pequena deste
grupo é visível nesta representação

grupo
heme

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Proteína globular: mioglobina

O grupo heme é uma molécula cíclica orgânica
O ponto mais importante – o íon Fe2+ pode fazer 6 ligações de
coordenação
o grupo heme é estruturado para conter Fe2+ no centro, de tal
maneira que faz 4 ligações de coordenação com átomos de N

a quinta posição de coordenação do Fe2+

faz ligação com um N de um grupo R de
histidina da cadeia polipeptídica

a sexta posição de
coordenação do Fe2+ é
disponível para fazer
ligação com O2
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8
Proteína globular: mioglobina
O grupo heme – modelo de espaço-cheio

17

18
mioglobina – modelo em fita – representação estéreo – sem heme

9
 19
mioglobina – contorno da superfície – representação estéreo

Proteína globular: mioglobina

os resíduos hidrofóbicos são, na maior parte,
escondidas no interior da proteína
grupo heme

resíduos
hidrofóbicos

todos os grupos R
polares, exceto dois,
são expostos na
superfície externa da
molécula, onde podem
interagir com água
20

10
Isto é um princípio geral para proteínas globulares que
ficam em solução aquosa (por exemplo, no citoplasma)

• a maioria dos resíduos de aminoácidos com grupos R

hidrofóbicos é encontrada, “escondida”, no interior da
proteína

• a maioria dos resíduos de aminoácidos com grupos R

hidrofílicos é encontrada, “exposta”, na superfície da proteína

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Proteína globular com estrutura

quaternária: hemoglobina
• presente nos eritrócitos
• tem função de transportar O2 dos pulmões até os
tecidos
• é um tetrâmero – contém 4 proteínas globulares
(chamados de subunidades) com semelhanças à
mioglobina (cada subunidade contém um grupo heme),
que formam um agregado
• tem dois tipos de subunidades diferentes, subunidades
α e subunidades β. Estas duas subunidades têm
estruturas tridimensionais bem semelhantes àquela de
mioglobina
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11
Proteína globular: hemoglobina
Representação em fita Modelo de espaço-cheio
subunidades α - cada tem 141 resíduos

subunidades β - cada tem 146 resíduos

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Proteína globular: hemoglobina

Não tem ligações covalentes entre as diferentes
subunidades, mas, mesmo assim, a interação entre elas é
forte. Esta interação se deve a
• interações hidrofóbicas (entre grupos R não polares)
• íons emparelhados (ou seja, entre grupos R positivamente
carregados e grupos R negativamente carregados)
• pontes de hidrogênio entre grupos R polares mas não carregados

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12
 Sistema complexo: miosina + actina

miofibrila

filamento
filamento fino
grosso

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O filamento grosso é feito de miosina

um dímero de
miosina

aminoterminais
duas α-hélices
carboxiterminais superespiraladas

parte fibrosa parte globular

26

13
 O filamento fino é feito de actina
uma
subunidade de
actina G

actina F = dois filamentos feitos por

subunidades de actina G.
Os dois filamentos são superespiralados actina G é uma
proteína globular
cabeça de
miosina
cada subunidade G Não tem
no filamento tem um ligação
sítio onde a cabeça covalente
globular de miosina entre as
pode ligar subunidades
de actina G !
filamento de actina 27

relaxado

contraído

cada filamento
grosso é
circundado por
6 filamentos
finos
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14
 a cabeça
dissocia da
actina

filamento grosso filamento grosso

para cada ciclo,
repete o ciclo (mas tem tem, como
que mudar as cores no a cabeça muda
resultado,
diagrama acima!) de posição
ATP→ADP + PO43-

filamento grosso filamento grosso

a cabeça se a cabeça se liga

movimenta, ao filamento de
arrastando o actina
filamento de actina filamento grosso
à esquerda
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Denaturação

Princípio importante:
A função de uma proteína depende de sua
estrutura tridimensional

30

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Denaturação adição de agente desnaturante
(T alta, pH alto ou baixo, agentes químicos)
desnaturação

enovelado parcialmente totalmente

corretamente desenovelado desenovelado
tem função não tem função não tem função

volta enovelamento correto = renaturação

estrutura (a desnaturação foi “reversível”)
“nativa”,
tem função remoção de agente desnaturante
(volta T, pH para valor normal, remove agente químico)
não tem
função enovelamento errado (a desnaturação foi “irreversível”)31

Denaturação
Também é possível que as proteínas desenovelados
formem um agregado de cadeias (que não se desagrega
quando o agente de desnaturação é removido)

por exemplo,
calor

resfriar
proteínas agregado de
enoveladas cadeias
corretamente desenoveladas
não volta!!!
32

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exemplo – desnaturação da albumina do ovo

33
http://iopscience.iop.org/0953-8984/24/50/503101/article

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