28/02/2020
Bioquímica Estrutural e Metabólica
Aminoácidos e Proteínas pt.2
Visão Geral
As proteínas são as macromoléculas mais
abundantes nos seres vivos, estando presentes nas
células vivas e no espaço extracelular (tecidos). Elas
são os instrumentos moleculares por meio das quais
a informação genética é expressa.
Elas exibem uma grande diversidade de funções
biológicas e são fundamentais para qualquer ser
vivo, sendo praticamente todos os processos vitais
dependentes dessa classe de moléculas.
A sequência dos radicais variáveis do aminoácido dá
a forma tridimensional a proteína e define o
dobramento.
Todas as proteínas são diferentes entre si.
A carga de uma proteína contribui no dobramento.
Chaperonas
São proteínas do corpo humano sintetizadas nos
ribossomos livres que incorporaram mecanismos
bastante eficientes para evitar que erros na
transmissão da informação genética se propaguem
na replicação/dobramentos, na transcrição e na
tradução.
Estruturas de Proteínas
O termo estabilidade pode ser definido como a
tendência em manter a conformação nativa de uma
proteína, mas não significa que está parado.
A natureza modular da síntese e do dobramento da
proteína está incorporada no conceito das ordens da
estrutura da proteína:
Estrutura Primária: a sequência de aminoácidos
em uma cadeia polipeptídica;
Estrutura Secundária: o dobramento de segmentos
curtos e contíguos do polipeptídeo em unidades
geometricamente ordenadas;
Estrutura Terciária: a reunião das unidades
estruturais secundárias em unidades funcionais
maiores;
Estrutura Quaternária: o número e os tipos de
unidades polipeptídicas de proteínas e suas
conformação espaciais.
Toda proteína chega até a estrutura terciaria e
algumas precisam se ligar a outras para formar a
estrutura quaternária.
Cada tipo de proteína possui uma sequência de
aminoácidos única que confere uma determinada
estrutura tridimensional. Essa estrutura, por sua vez,
confere uma função especifica.
Conformação Espacial
Os 20 aminoácidos “padrões” se diferem no seu
grupo R, levando em consideração: tamanho;
formato; reatividade; carga; e formação de ligações
de hidrogênio.
As proteínas exercem sua função somente em
conformações terciárias ou quaternárias.
O arranjo espacial doa átomos em uma proteína é
chamado de conformação.

As interações não-covalentes são as forças mais
importantes que estabilizam a estrutura terciária e
quaternária
Cadeias laterais = Radicais
Os aminoácidos moldam as propriedades das
proteínas, tendo diferentes cadeias laterais,
dividindo-se em 3 capacidades (tamanho, forma e
carga):
Capacidade de preencher o interior da proteína;
Capacidade de ionização e reatividade química;
Capacidade de forma ligações com íons hidrogênio.
Conformação/Estrutura Primária
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É uma sequência linear de aminoácidos ligados
através de ligações peptídicas. A sequência é
determinada geneticamente a partir do DNA.
Por convenção, a sequência de aminoácido é sempre
descrita da região N-terminal (fora da membrana -
NH3+) para a região C-terminal (dentro da célula -
COO-).
Conformação/Estrutura Secundária
É caracterizada pelas interações e presença de pontes
de hidrogênio que acontece entre os radicais, porém
não com todos. Há 3 tipos principais de estruturas
secundárias, divididas por causa da sequência de
aminoácidos determinados pelo DNA:
α-Hélice - O esqueleto polipeptídico é firmemente
enrolado em torno de um eixo imaginário desenhado
longitudinalmente no centro da hélice e os grupos R
dos resíduos de aminoácidos se projetem para fora
do esqueleto helicoidal A estabilização ocorre por
ligações de H entre aminoácidos próximos (pontes
de hidrogênio)
Lembra um formato de fio de telefone.
Folhas β - A estrutura de folha pregueadas resulta da
formação de pontes de hidrogênio entre a cadeia
polipeptídica adjacente (entre as proteínas). As
regiões vizinhas da cadeia polipeptídica associam-se
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por meio de ligações de hidrogênio, resultando em A estrutura terciaria é o resultado do enovelamento
uma estrutura achatada e rígida. dos 3 tipos de estruturas secundárias (α-Hélice,
Folhas β e Curvaturas β).

Curvaturas β –
Conectam os
segmentos de hélice
alfa e folhas beta,
mudando a direção da cadeia. São estruturas

estabilizadas por ligações de H entre os grupos Cα–

C=O e H–N–Cα da cadeia principal do AA n e n +
3. Existem dois tipos que se distinguem pela
angulação das ligações

Se assemelha a um ninho.

Conformação/Estrutura Terciária
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Na estrutura terciária aminoácidos que estão bem A estrutura quaternária são 2 ou mais cadeia
distantes na sequência polipeptídica e em diferentes polipeptídicas, que podem ser estruturalmente
tipos de estruturas secundárias podem interagir na idênticas ou totalmente diferentes, podendo
estrutura da proteína completamente dobrada. funcionar independentemente um das outras ou
Ganham um dobramento especial graças a outras trabalhar cooperativamente como ocorre na
interações entre os radicais do mesmo esqueleto. hemoglobina.
As interações que estabilizam a estrutura terciária As subunidades são unidades por interações não-
podem se dividir em: covalentes, como por exemplo ligações de
hidrogênio, ligações iônicas ou interações
Pontes dissulfeto (só
um tipo realiza);
Interações
hidrofóbicas;
Ligações de
Hidrogênio;
Interações iônicas;
hidrofóbicas.

Depende do balanço geral das interações não-

covalentes.
Estabilizada por interações diversas entre as cadeias
laterais e pontes dissulfeto. As ligações de H têm
pequenas contribuições devido à competição com a
água.
Os motivos estruturais da conformação terciárias, As interações que estabilizam a estrutura quaternária
deve-se as combinações entre diferentes arranjos de podem se dividir em:
estruturas secundárias, como por exemplo:
Pontes dissulfeto (só
Formam padrões comuns/recorrentes de um tipo realiza);
Interações
hidrofóbicas;
Ligações de
Hidrogênio;
enovelamento; Interações iônicas;

Formam domínios característicos de famílias de

proteínas.

Conformação/Estrutura
Quaternária

Domínios – Conformação
Terciária
São estruturas autônomas funcionais, que consistem
em combinações de motivos. Proteínas pequenas
tem 1 domínio (própria proteína). Proteínas com
mais de 200 resíduos são multidomínios.
Enovelamento
A maioria das proteínas deve manter certa
flexibilidade conformacional para funcionar.
A proteostase celular (manutenção continua do
grupo ativo de proteínas celulares) requer a atividade
coordenada de vias para síntese e enovelamento de
proteínas, o redobramento de proteínas parcialmente
desdobradas e o sequestro e degradação de proteínas
irreversivelmente desdobradas. Em todas as células,
essas redes envolvem centenas de enzimas e
proteínas especializadas.
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Desnaturação Proteica
As estruturas proteicas evoluíram para atuar em
determinados ambientes celulares, logo, condições
diferentes daquelas da célula podem resultar em
mudanças estruturais grandes ou pequenas na
proteína. A perda de estrutura tridimensional
suficiente para causar a perda de função é chamada
de desnaturação proteica, que resulta no
desdobramento e na desorganização das estruturas
terciárias e quaternárias em secundárias e primárias,
sem que ocorra hidrólise das ligações peptídicas.
O estado desnaturado não necessariamente
corresponde ao desdobramento completo da proteína
e à randomização da conformação. Na maioria das
condições, as proteínas desnaturadas existem como
um conjunto de estados parcialmente dobrados.
Proteínas podem ser desnaturadas por agentes
desnaturantes (físicos químicos): calor, solventes
orgânicos, agitação mecânica, ácidos os bases fortes,
detergentes, íons metálicos pesados (ex. chumbo e
mercúrio).
Na maioria dos casos a desnaturação não é
reversível.
Desnaturação Mecânica
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construção de grandes estruturas. Em geral são
formadas por um único tipo de estrutura secundária
e sua estrutura terciária e relativamente simples.

Níveis de Organização das

Proteínas
As proteínas podem ser divididas em globulares ou
fibrosas, segundo sua forma.
Globulares: São cadeias esféricas ou globulares,
com diversos tipos de estruturas, possuindo função
enzimática, reguladoras, de defesa, transporte, etc.

As cadeias
polipeptídicas se dobram formando estruturas
compactas, sendo os módulos cadeias polipeptídicas
estruturas globulares, como por exemplo,
hemoglobina, enzimas e mioglobinas. As proteínas
globulares normalmente contêm diversos tipos de
estruturas
secundárias e,
portanto, estruturas
tridimensionais mais
complexas.
Fibrosas: São
cadeias longas e
geralmente
insolúveis, tendo
função estrutural, de
suporte, elasticidade
e proteção, formadas
pela associação de
módulos repetitivos,
possibilitando a